Bon, ça ne peut pas être considéré comme une solution mais j'ai trouvé quelque chose.
En cherchant un peu partout j'ai trouvé un logiciel (payant)
networkmagic.com J'ai pris la version trial, installé et configuré pour partager les dossiers que je voulait.
Après vérification ça marchait parfaitement je vois dorénavant les fichiers précédemment invisibles.
Je l'ai désinstallé en croisant les doigts (vu que de toute façon c'est un trial limité à 7 jours je ne peux pas le garder comme solution définitive, et un programme tiers pour gérer son réseau c'est vraiment naze comme concept). Et miracle je continue a voir les fichiers invisibles.
Maintenant, je ne sais pas ce qu'il a fait, je ne sais toujours pas pourquoi ça plantait (et j'aimerais bien le savoir) et je n'ai pas de vrai solution définitive si jamais ça se reproduit.
De plus je ne sais pas si le problème est définitivement réglé pour ce dossier ou si lors que de nouveaux fichiers seront crées ils seront a nouveau invisibles. Je croise les doigts pour le moment.
Je suis toujours à la recherche d'une "vraie" solution.